Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms