Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms