Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4BQ2VIQ3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms