Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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