Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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