Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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GEN1Q17RS7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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GEN1Q17RS7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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GEN1Q17RS7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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GEN1Q17RS7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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GEN1Q17RS7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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GEN1Q17RS7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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