Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME3Q16798 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME3Q16798 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME3Q16798 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME3Q16798 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME3Q16798 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME3Q16798 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME3Q16798 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME3Q16798 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME3Q16798 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME3Q16798 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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