Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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