Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FOXD1Q16676 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
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