Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ETFDHQ16134 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms