Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK4Q16099 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK4Q16099 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK4Q16099 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK4Q16099 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK4Q16099 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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