Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITSN1Q15811 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
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