Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRADDQ15628 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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