Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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RYR3Q15413 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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RYR3Q15413 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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RYR3Q15413 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RYR3Q15413 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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