Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUM3Q15397 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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