Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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GBX1Q14549 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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GBX1Q14549 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GBX1Q14549 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GBX1Q14549 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GBX1Q14549 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBX1Q14549 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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