Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNQ14247 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms