Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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