Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms