Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
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