Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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TUBB3Q13509 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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TUBB3Q13509 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBB3Q13509 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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