Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME3Q13232 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME3Q13232 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms