Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ERCC8Q13216 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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ERCC8Q13216 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ERCC8Q13216 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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