Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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RPA4Q13156 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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