Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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TRAF2Q12933 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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TRAF2Q12933 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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TRAF2Q12933 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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TRAF2Q12933 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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