Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCB1Q12824 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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