Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCAPQ12770 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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