Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM27E3Q08E93 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms