Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms