Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGM3Q08188 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms