Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FMODQ06828 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FMODQ06828 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FMODQ06828 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms