Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms