Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms