Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPCQ01831 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPCQ01831 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPCQ01831 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPCQ01831 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPCQ01831 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
XPCQ01831 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPCQ01831 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPCQ01831 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPCQ01831 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPCQ01831 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
XPCQ01831 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
XPCQ01831 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
XPCQ01831 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XPCQ01831 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XPCQ01831 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XPCQ01831 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPCQ01831 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPCQ01831 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPCQ01831 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms