Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA5Q01523 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA5Q01523 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms