Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms