Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL8P80075 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL8P80075 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL8P80075 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL8P80075 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL8P80075 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL8P80075 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms