Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX3P78415 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX3P78415 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX3P78415 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX3P78415 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX3P78415 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms