Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UFM1P61960 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UFM1P61960 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms