Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms