Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF3P57682 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF3P57682 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF3P57682 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF3P57682 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF3P57682 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF3P57682 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF3P57682 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLF3P57682 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF3P57682 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF3P57682 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF3P57682 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF3P57682 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms