Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBASH3AP57075 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBASH3AP57075 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBASH3AP57075 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBASH3AP57075 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBASH3AP57075 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3AP57075 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms