Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOSBP53539 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FOSBP53539 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOSBP53539 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOSBP53539 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOSBP53539 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOSBP53539 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOSBP53539 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms