Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNQ1P51787 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms