Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SMARCA4P51532 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms