Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAMP50895 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAMP50895 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAMP50895 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAMP50895 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BCAMP50895 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAMP50895 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAMP50895 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms