Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK8P49336 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK8P49336 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK8P49336 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK8P49336 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK8P49336 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK8P49336 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK8P49336 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK8P49336 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK8P49336 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK8P49336 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK8P49336 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK8P49336 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK8P49336 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK8P49336 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK8P49336 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK8P49336 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK8P49336 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms