Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRIP1P48552 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms