Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCLMP48507 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCLMP48507 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCLMP48507 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCLMP48507 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCLMP48507 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GCLMP48507 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCLMP48507 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCLMP48507 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCLMP48507 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCLMP48507 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCLMP48507 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCLMP48507 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCLMP48507 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCLMP48507 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms