Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCLCP48506 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCLCP48506 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCLCP48506 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GCLCP48506 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCLCP48506 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GCLCP48506 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCLCP48506 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCLCP48506 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCLCP48506 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCLCP48506 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCLCP48506 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCLCP48506 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCLCP48506 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCLCP48506 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCLCP48506 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCLCP48506 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCLCP48506 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCLCP48506 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCLCP48506 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCLCP48506 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCLCP48506 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCLCP48506 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCLCP48506 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms